Атлас микробных сообществ Российской Федерации

На подготовительном этапе командой специалистов участников проекта будут собраны образцы воды, донных субстратов, морских обитателей и почв различных природных объектов на территории России.

Образцы будут надлежащим образом обработаны в корабельных и/или стационарных лабораториях и секвенированы для получения данных о разнообразии бактериальных сообществ в рамках исследовательской программы проекта. К осуществлению обработки данных метагеномного секвенирования будут привлекаться волонтеры - обучающиеся различных уровней образования. Результатом работы каждого волонтера будут данные о количественном филогенетическом составе конкретного микробного сообщества, выбранного им для анализа. Каждый образец будет проанализирован не менее, чем тремя независимыми волонтерами. В случае несовпадения результатов, такой образец будет дополнительно проанализирован куратором - профессиональным биоинформатиком и будут проведены консультации с волонтерами для выявления возможных причин расхождений. Выполняемая волонтерами работа по обработке данных секвенированияметагеномов позволит значительно ускорить обработку большого количества полученных данных высокоэффективного секвенирования и перейти к предметному анализу состава микробных сообществ из различных образцов для решения научных задач проекта. Чтобы обеспечить вовлеченность участников, не имеющих специального опыта, процесс обработки данных будет сопровождаться поддержкой кураторов из числа научных сотрудников, аспирантов и студентов Сколтеха, принимающих участие в проекте. Вся работа обучающихся и их общение с кураторами будет происходить через интернет-портал проекта, что позволит привлечь к обработке данных не только учащихся из больших городов России, но и из отдаленных мест, включая сельские школы. Все, что будет необходимо волонтеру - участнику проекта, это соединение через интернет и желание стать частью большого проекта по составлению Атласа микробных сообществ России. Всего за время реализации проекта к выполнению научных задач в рамках гражданской науки планируется привлечь не менее 4 800 участников. Наиболее активные участники проекта из числа волонтеров будут приглашены выступить с докладами на ежегодной научно-практической конференции молодых ученых "Микробиология природных сообществ", проводимых в Сколтехе. Данный шаг позволит приобщить молодых исследователей-волонтеров к университетской и академической среде и дополнительно поддержать интерес учащихся к исследовательской деятельности в области молекулярной генетики и биоинформатики.