Дело пыльное: как исследование микрочастиц помогает ученым совершать открытия

Где бы мы ни оказались, нас повсюду окружает пыль — домашняя, уличная, природная. Такие незначительные на первый взгляд частицы с точки зрения науки скрывают много интересного. Например, дома в одном фрагменте пыли можно найти омертвевшие клетки кожи, насекомых, пыльцу растений и огромный микробиом. Как по ним ученые исследуют древнюю и современную ДНК? Что такое лёссы? И сколько микрометеоритов падают на дачные участки? Разбираемся в нашем материале.


«Генетика без костей»

Для начала разберемся, что такое пыль? В широком смысле, это сложная мелкодисперсная смесь органических и неорганических частиц (англ. particulate matter, PM). В зависимости от их размера, различают несколько видов пыли. Например, PM10 — частицы размером 10 микрометров или меньше (1 микрометр равен 0,001 миллиметров), а также PM2.5 — частицы размером 2,5 микрометров и менее.

Такие частицы — довольно распространенный загрязнитель атмосферного воздуха. Согласно международным исследованиям, пыль, относящаяся к категории РМ2.5, негативно влияет на здоровье человека. Проникая глубоко в легкие, она повышает риск респираторных и сердечно-сосудистых заболеваний.

То, что мы привыкли называть пылью, чаще всего является источником вредных и даже опасных соединений. В науке мелкие частицы, в особенности природного происхождения — ценный объект для исследований.

Например, в современной археологии и палеогенетике пыль, или осадочные породы, из пещер и культурных слоев произвели настоящую революцию. Почему? Раньше ученые могли воспроизвести портрет древнего человека только по костям и зубам, сохранившимся в раскопе. Сегодня для этого достаточно экологической ДНК (eDNA)*. По ней исследователи могут понять, кто здесь жил, даже если других фрагментов и артефактов не сохранилось.

«Я называю такой вид исследований „генетикой без костей“. Организмы постоянно оставляют в окружающей среде следы своей жизнедеятельности. По сути, экологическая ДНК — это настоящий слепок экосистемы конкретного места в конкретный момент времени. Минералы в пещерной пыли (особенно глина) связывают эти обрывки ДНК, защищая их от полного распада», — рассказывает научный сотрудник Южного научного центра РАН, кандидат биологических наук Ольга Арамова.


По ДНК, найденной в одном грамме древней пыли, можно узнать видовую принадлежность, пол, индивидуальные генетические признаки людей. По молекулам крупных и мелких млекопитающих — реконструировать рацион древних жителей и фаунистический состав региона. Иногда в культурном слое сохраняются молекулы почвенных бактерий и микроорганизмов, связанных с деятельностью человека.

«Мы не просто можем определить, что ели древние люди, а конкретные виды злаков и трав, преобладавших в рационе. Пыль хранит и то, чем болели люди и когда к их кострам пришли первые волки. В почвенных слоях находят ДНК патогенов, а по наличию специфической ДНК псовых в жилых слоях пещер исследователи уточнили сроки одомашнивания волков», — говорит эксперт.

Конечно, пыль не настолько надежный источник, как кости или зубы, однако у этого материала есть колоссальное преимущество. Если кость содержит информацию о конкретном человеке, то пыль, собранная с пола пещеры, дает макрокартину. Она расскажет не только о человеке, но и о собаке, которая спала рядом, о мышах, которые бегали по углам, и о растениях, которые цвели снаружи, отмечает Ольга Арамова.

«Винегрет» из ДНК

Благодаря таким исследованиям несколько лет назад из знаменитой Денисовой пещеры на Алтае, где не нашли ни одной человеческой кости, ученые смогли выделить и расшифровать ядерную ДНК неандертальцев и денисовцев, обитавших там сотни тысяч лет назад. В другом прорывном исследовании международная группа ученых обнаружила в отложениях Гренландии экологическую ДНК возрастом около двух миллионов лет. До этого считалось, что срок годности таких молекул в вечной мерзлоте может составлять не более одного миллиона лет.

Чтобы проанализировать ДНК в частицах пыли, ученые отбирают пробы грунта на разных уровнях раскопа и замораживают образцы. Затем в лабораториях с избыточным давлением (чтобы современная пыль не залетала внутрь) с помощью химических реагентов вымывают обрывки молекул нуклеиновых кислот.

Используя технологии NGS (секвенирование нового поколения), расшифровывают фрагменты ДНК и получают огромный текстовый файл. Секвенатор выдает «винегрет» из ДНК — гены бактерий, мамонта, сосны и неандертальца. На этом этапе возникает сложная задача: отыскать среди терабайтов генетического мусора крупицы ценных молекул.

Разделить их помогает искусственный интеллект. Алгоритмы на базе машинного обучения мгновенно сверяют миллионы коротких фрагментов с эталонными базами данных живых существ. В том числе помогают отличить древние молекулы от современных.

«Во-первых, древняя ДНК всегда сильно фрагментирована. Во-вторых, со временем на концах молекул ДНК происходит особая химическая реакция: дезаминирование цитозина. Цитозин (Ц) превращается в урацил (У), который при секвенировании читается как тимин (Т). Компьютерные алгоритмы ищут этот характерный паттерн старения на концах фрагментов. Если он есть, значит ДНК древняя. Если молекулы длинные и целые — это ДНК археолога, который случайно чихнул на раскопе», — объясняет специалист.

«Пылевые» методы активно набирают популярность в криминалистике. Специалистам больше не нужны отпечатки пальцев или капли крови. Достаточно собрать пыль с плинтусов или извлечь частицы из кондиционерных фильтров. Если человек находился в помещении хотя бы 15 — 20 минут, его генетический автограф оседает в воздухе и на поверхностях, сохраняясь там месяцами. Так пыль становится немым свидетелем, позволяющим реконструировать события прошлого — как в масштабе тысячелетий, так и в пределах недавнего преступления.

Летопись природных ландшафтов

В геологии пыль тоже является важным объектом для исследований. Только здесь ученых интересуют частицы, образованные без вмешательства человека: вулканические, минеральные (геологические), морские (аэрозоли), органические (пыльца, споры), космические. Изучая их состав, ученые могут определить, как менялся климат в прошлом, восстановить облик древних ландшафтов.

«Пыль легко переносится воздушными потоками. Например, существует такое явление, как западный перенос воздушных масс. Это преобладающий перенос воздуха с запада на восток в тропосфере и стратосфере, характерный для умеренного пояса на территории Евразии. Изучая частицы минеральной пыли и вулканического пепла в этих регионах, можно проследить эволюцию ветров, рост горных сооружений и проявления вулканизма», — комментирует старший научный сотрудник лаборатории главного геомагнитного поля и петромагнетизма Института физики Земли РАН, кандидат геолого-минералогических наук Александр Пасенко.

Распространяясь на тысячи километров, пепловые частицы оседают в различных отложениях и образуют так называемые прослои — тефры. Определив их химический состав, ученые могут понять, из какого вулкана пришла пыль (поскольку у каждой вулканической постройки свой уникальный геохимический «паспорт»), и связать возраст прослоя с датой извержения.

Отдельная область исследований — изучение магнитных частиц в составе минеральной пыли. Измеряя их ориентацию в пространстве с помощью современных приборов, геологи определяют направление ветров в момент осаждения этих частиц из воздуха.

Пыль находят даже на дне озер, морей и океанов. Например, изучая образцы (чаще всего) озерных донных отложений под микроскопом, можно встретить металлические шарики размером в несколько микрометров. Такие частицы имеют внеземное происхождение. Попадая к нам из космоса, они рассеиваются в атмосфере и оседают на морских глубинах. Но геологов эти объекты привлекают не своим происхождением, а магнитными свойствами.

«По космической пыли на дне морей и океанов можно узнать, каким было магнитное поле Земли в момент их падения. Условно говоря, попадая в толщу породы, эти космические магнитные частицы ориентируются по направлению магнитного поля как компас и в таком виде „запечатываются“ в осадке», — рассказывает специалист.

Климатический архив

Еще один вид пыли, представляющий интерес для геологов — так называемые лёссы. Это горная порода состоит в основном из минеральной пыли, перенесенной ветрами в естественные «ловушки». Чаще всего она встречается в умеренных широтах, в том числе в странах Средней Азии. Лёссовые толщи переслаиваются с погребенными почвами, отражая климатические изменения.


Главная особенность лёссов в том, что они формировались исключительно на протяжении четвертичного периода — геологической эпохи, наступившей около 2,6 миллионов лет назад и которая продолжается по сей день.

«Этот период отличается контрастными колебаниями климата, когда ледниковые периоды, характеризующиеся холодным и сухим климатом с усилением ветрового переноса пыли, сменяются потеплениями, благоприятными для развития почвы. По итогу мы имеем лёссово-почвенные архивы, наиболее полно регистрирующие каждое такое изменение климата», — делится научный сотрудник лаборатории главного геомагнитного поля и петромагнетизма ИФЗ РАН Екатерина Кулакова.

Сопоставляя лёссово-почвенные отложения с другими климатическими архивами, ученые оценивают возраст их накопления. Результаты подтверждают абсолютными геохронологическими методами. Например, с помощью люминесцентного датирования. Дело в том, что у любой горной породы есть естественный радиоактивный фон и дефекты в кристаллической решетке минералов. Эти дефекты работают как ловушки возбужденных электронов, получивших энергию от ионизирующего излучения радиации. По таким «батарейкам» можно определить возраст горных пород: чем больше энергии накопилось, тем ярче свечение частиц и тем древнее материал. Однако, попадая на свет, эти «аккумуляторы» обнуляются. Поэтому легко извлечь образцы при дневном освещении не получится.


«Конечно, можно прийти ночью на место отбора проб с красными фонариками, очистить стенку, добраться до материала, который не облучается светом, и сложить образцы в светонепроницаемые пакеты. Но иногда отложения вскрываются крутыми вертикальными траншеями. Взбираться по ним в темное время суток небезопасно», — комментирует эксперт.

Более удобный способ: отбирать горные породы, вбивая в них непрозрачные трубы. Так образцы, попадающие в центральную часть конструкции, не контактируют со светом. Собранные материалы исследуют в специальных комнатах с красным освещением, напоминающие фотолаборатории.

Часто в разновозрастных погребенных почвах лёссово-почвенных отложений находят древние каменные орудия, отщепы или необработанные гальки, оставленными людьми. Для таких артефактов существует археологический термин — лёссовый палеолит. Эти находки говорят о многократном пребывании древних людей на территории, между этапами которого могли пройти десятки и даже сотни тысяч лет.


«Одним из таких регионов является Южный Таджикистан. Изучение находящихся там лёссово-почвенных отложений позволяет ответить на фундаментальные вопросы: когда древние представители рода Homo пришли в Центральную Азию и какой был климат в то время. В ходе одного из таких исследований геологам удалось определить возраст находок», — рассказывает Екатерина Кулакова.

Космический след

По современным научным данным, в атмосферу нашей планеты попадает примерно 15 000 тонн космической пыли в год. Это микрометеориты диаметром от примерно 30 микрон до нескольких миллиметров, а также более мелкие пылинки, которые называют межпланетными пылевыми частицами (англ. Interplanetary Dust Particles, IDP).

Их источником принято считать пояс астероидов между орбитами Марса и Юпитера, в котором объекты сталкиваются и дробятся, образуя пыль. Также, некоторые частицы происходят из каменной фракции ледяных ядер комет, выброшенных при их прохождении вблизи Солнца. Эта пыль формирует зодиакальное облако*.


Несмотря на внушительные объемы космической пыли, до поверхности Земли долетает лишь 10 — 20% от общей массы. Большинство микрометеоритов из-за атмосферного трения плавятся, выпадая в виде космических шариков, или полностью испаряются.

Другие частицы, которые не так сильно нагреваются, осаждаются как шлаковидные, содержащие реликтовые тугоплавкие зерна и непереплавленные микрометеориты. Эти материалы — наиболее ценный объект для изучения: в отличие от космических шариков, их минеральный и химический состав не модифицирован плавлением и испарением.

«Нетрудно подсчитать, что на садовый участок в шесть соток за год выпадает примерно 130 космических шариков. Однако выделить их крайне сложно из-за осаждения техногенных частиц, получающихся при металлообработке, и других загрязнений», — объясняет заведующий Лабораторией метеоритики Института геохимии и аналитической химии им. В. И. Вернадского РАН, кандидат геолого-минералогических наук Дмитрий Бадюков.

Поэтому искать космическую пыль удобнее всего на ледниках Антарктиды, Гренландии и Новой Земли, где воздух и снег остаются одними из самых чистых на планете. Внеземной материал извлекают из криоконита — частиц на поверхности ледника, состоящих из горных пород и цианобактерий.

«Поскольку источники космической пыли весьма разнообразны, мы можем исследовать вещество, не присутствующее среди известных метеоритов и, соответственно, получать новую информацию. С другой стороны, есть существенное ограничение: малые размеры микрометеоритов затрудняют воссоздание исходной породы», — говорит кандидат геолого-минералогических наук Дмитрий Бадюков.

Хотя особого практического применения метеориты и космическая пыль пока не находят, с их помощью можно воссоздать ранние этапы эволюции Солнечной системы. В последнее время эта область развивающейся науки приносит новые результаты, которые имеют важное фундаментальное значение, подчеркивает эксперт. 

«В лаборатории метеоритики и космохимии ГЕОХИ РАН исследуются микрометеориты, собранные на ледниковом щите Новой Земли. Основное преимущество этой коллекции — изобилие материала по сравнению с антарктическими коллекциями. Мы изучаем редкие и уникальные типы непереплавленных микрометеоритов, то есть не испытавших изменений при пролете через атмосферу. Естественно, в нашем распоряжении должно находиться весьма большое количество материала», — рассказывает специалист.

   Чтобы узнать, из чего состоят такие частицы и какую ценность представляют для исследователей, не обязательно отправляться в далекие экспедиции. Ознакомиться с необычными образцами можно в Музее внеземного вещества ГЕОХИ РАН или в Минералогичесом музее имени А. Е. Ферсмана РАН. О лёссах и других видах осадочных горных пород расскажут в Государственном геологическом музее имени В. И. Вернадского РАН. Прогуливаясь по этим музеям, можно узнать, чем отличается космическая пыль от минеральной и как в науке такие частицы становятся источником важных открытий.


Анна Шиховец