заместителем директора по научной работе Института экспериментальной медицины, член-корреспондентом РАН, доктором биологических наук, грантополучателем Российского научного фонда, чтобы разобраться в современных подходах к созданию комбинированных и универсальных вакцин.
— Каковы современные подходы к разработке комбинированных вакцин, и какие результаты уже достигнуты в исследовании?
— В классическом понимании комбинированные вакцины — это одномоментное введение вакцин от разных инфекционных патогенов (как вирусной, так и бактериальной природы). Известный всем родителям пример — вакцина Пентаксим, которая содержит пять вакцин от дифтерии, столбняка, гемофильной инфекции, полиомиелита и коклюша. Или другой пример — комбинация корь-краснуха-паротит (MMR) — тоже смесь из трех отдельных вакцин. В этих случаях каждая вакцина готовится по своим технологическим регламентам, и в свое время прошла все необходимые клинические исследования, показавшие её высокую профилактическую эффективность. А ввиду того, что защитить детей в первые месяцы жизни необходимо сразу от большого числа инфекций, были разработаны комбинированные схемы вакцинации, при которых совместное введение вакцин не приводит к явлению интерференции, подразумевая, что комбинация вакцин работает также хорошо, как каждая вакцина по отдельности. Когда пришла пандемия COVID-19, и при этом стало понятным, что вирусы гриппа также никуда не делись, многие фармацевтические компании стали разрабатывать комбинированные вакцины от гриппа и COVID-19, используя различные вакцинные платформы. Чаще всего принцип такой же, как в приведенных выше примерах — когда отдельно производится вакцина от гриппа, а отдельно — вакцина от COVID-19, и потом они объединяются в одном флаконе для последующей вакцинации. Так были разработаны комбинированные вакцины на основе рекомбинантных вирусных белков, различных вирусных векторов, а также с использованием мРНК-технологии.
— Почему возникла необходимость в создании универсальной вакцины, такая вообще возможна? Это что-то типа универсальной «таблетки»?
Необходимость в создании универсальной вакцины возникает из-за постоянной эволюционной изменчивости РНК-содержащих вирусов, что приводит к возникновению новых вспышек заболеваний, и даже пандемий. Появление новых штаммов требует постоянной актуализации штаммового состава вакцин, и зачастую, пока новая вакцина готовится в лаборатории и проходит все стадии исследований, вирус успевает мутировать, и такая вакцина уже оказывается бессильной против следующего варианта вируса. В этом контексте универсальная вакцина, которая может защищать против широкого спектра вирусных штаммов, и которая не требует постоянного обновления, действительно, может стать аналогом универсальной «таблетки».
— Каковы основные достижения вашей команды в разработке универсальной вакцины, и как они могут повлиять на будущие пандемии?
В контексте нашей разработки бивалентной вакцины против гриппа и COVID-19 «универсальным» можно назвать «коронавирусный» компонент, поскольку в геном вакцинных штаммов вируса гриппа встраивались очень консервативные фрагменты генома SARS-CoV-2, и даже за пять лет после появления вируса в циркуляции в отобранных нами фрагментах практически не произошло изменений. Соответственно, иммунный ответ на эти участки будет оставаться эффективным и при смене геновариантов SARS-CoV-2 — в ситуации, когда стандартные вакцины, нацеленные на поверхностный Spike белок, уже утрачивают свою эффективность. Тут можно даже предположить, что в случае возникновения пандемии, вызванной появлением совсем нового варианта коронавируса, наша вакцина также сможет обеспечить определенный уровень защиты, поскольку в состав вакцинных штаммов включались участки, одинаковые у коронавирусов SARS-CoV-1, вызвавших вспышку атипичной пневмонии в Китае в 2003 году, и новых коронавирусов, появившихся в циркуляции только в 2019 году.
— Как вы оцениваете эффективность вакцины, которую разрабатываете?
— Как скоро такая вакцина появится для применения в мед практике?
Сроки появления вакцины в медицинской практике зависят от успешного завершения клинических испытаний и получения всех необходимых разрешений. Важно помнить, что качественная разработка может занять годы, но наша команда, совместно со специалистами нашего индустриального партнера АО «БИОКАД», активно работаем над ускорением этого процесса.
— Каковы основные вызовы, с которыми вы сталкиваетесь в своей исследовательской деятельности, и как их преодолеваете?
Пожалуй, основной вызов, с которым сталкиваются ученые-разработчики иммунобиологических препаратов сегодня — это недостаточное финансирование для оперативного внедрения разработок в медицинскую практику. Решить эти вопросы возможно только с привлечением к реализации проектов «квалифицированного заказчика» — т. е. индустриального партнера, производственные мощности которого позволят производить готовый продукт в необходимых объемах, чтобы обеспечить потребность в препарате для наиболее уязвимых групп населения РФ.
— Какие новые технологии или методы вы планируете использовать в своих исследованиях для улучшения иммунного ответа на вирусы?
— Какую роль играют Т-клетки в изучаемых вами вакцинах, и почему их активация важна для создания эффективного иммунного ответа?
Как уже указывалось выше, наша вакцина вызывает Т-клеточный иммунитет, он принципиально отличается от антител, на индукцию которых нацелено подавляющее число разрабатываемых вакцин от COVID-19. Т-клетки не нейтрализуют вирус, а убивают зараженную клетку. И активация именно Т-клеточного звена иммунитета является необходимой составляющей долгоживущего иммунного ответа на вакцины, т. к. формируется пул так называемых тканерезидентных Т-клеток памяти — это такие клетки, которые первыми встречают патоген во «входных воротах» инфекции и мгновенно активируются, вызывая каскад защитных иммунных реакций. А поскольку Т-клетки также являются долгоживущими, такое «патрулирование» входных ворот инфекции может продолжаться несколько лет, не требуя повторных иммунизаций.
— Как вы оцениваете тренды в разработке вакцин и иммунотерапий, которые появились за последние несколько лет?
Говоря о современных трендах в области разработки вакцин и других иммунотерапевтических препаратов, нельзя не упомянуть технологии мРНК-вакцин, которые продемонстрировали свою эффективность в борьбе с COVID-19, причем такие вакцины могут разрабатываться как средства профилактики инфекционных заболеваний, так и в качестве средства для подавления роста опухолей, поскольку технология мРНК позволяет целенаправленно доставлять в организм любой целевой антиген — будь то вирусный белок для индукции нейтрализующих антител, или опухолевый неоэпитоп для активации цитотоксических Т-клеточных реакций с целью уничтожения раковых клеток. Также актуальными остаются направления по созданию вакцин на основе рекомбинантных белков, которые нарабатываются в контролируемых системах экспрессии, и которые могут формировать вирусоподобные частицы (VLP). Такие вакцины стимулируют достаточно выраженный антительный и Т-клеточный ответ, и при этом не содержат вирусную РНК, т. е. не способны к самовоспроизведению — что повышает их безопасность. Наконец, не ослабевает интерес и к вакцинам на основе вирусных векторов, поскольку хорошо изученные лабораторные вирусы могут доставлять в организм человека любые целевые эпитопы, при этом обеспечивая их корректную презентацию иммунной системе для формирования максимально эффективного иммунного ответа.
— В каких направлениях вы видите наибольшие перспективы для научных открытий в области иммунологии в ближайшие годы?
Безусловно, будущие открытия в области иммунологии будут связаны с углубленным анализом профилей экспрессии генов в единичных клетках. Так, в настоящее время большинство исследований иммунного ответа связано с анализом клеточных субпопуляций — то есть анализируется огромное количество клеток в смеси. Среди которых обнаруживают те или иные фенотипические характеристики и определяют, какой процент клеток в лимфоидной ткани или барьерных органах реагирует экспрессией маркерных белков при стимуляции специфическим антигеном. Такие методы зачастую не позволяют выявить какие-то минорные клеточные популяции, и тут на помощь приходят современные технологии анализа единичных клеток — когда у каждой клетки в исследуемой смеси определяется профиль экспрессии огромного количества генов, и с помощью соответствующих методов анализа больших данных у ученых появляется максимально полная информация об этой клетке. Дальнейшие биоинформатические методики могут выявить такие закономерности в развитии иммунного ответа, которые невозможно определить никакими классическими рутинными методиками. Нет сомнений, что такие новые технологии в будущем откроют новые закономерности, например, при изучении влияния микробиома на иммунный ответ, при исследовании механизмов хронической инфекции и иммунного старения и т. п.
— Что вас вдохновляет на продолжение работы в области иммунологии и вирусологии, особенно с учетом трудностей, с которыми вы столкнулись за последние годы?
— Какие качества, по вашему мнению, наиболее важны для успешного ученого в вашей области, и как вы развивали эти качества в себе?
Наверное, можно выделить несколько ключевых качеств, которые позволяют ученым эффективно проводить исследования и достигать значительных результатов в нашей области медико-биологической науки. Во-первых, это страсть к научному познанию, стремление к пониманию природы тех процессов, которые лежат в основе выработки иммунного ответа на заражение вирусами и введение противовирусных вакцин. Без этого понимания сегодня невозможно создать новый эффективный и безопасный вакцинный препарат. Во-вторых, это критическое мышление, поскольку успешный ученый должен уметь объективно анализировать весь генерируемый объем информации, ставить под сомнение существующие теории и разрабатывать новые гипотезы. Развитие этого качества может происходить через участие в научных семинарах, чтение специализированной научной литературы и обсуждение данных с коллегами — как в России, так и за рубежом, поскольку вирусы не признают никаких границ. В-третьих, важную роль в жизни ученого играет настойчивость, поскольку далеко не каждый эксперимент может однозначно ответить на поставленный вопрос или привести к отрицательным разочаровывающим результатам, и вот успешный ученый умеет преодолевать все эти трудности и сохранять мотивацию, несмотря на неудачи. Наконец, настоящего успеха любой ученый может достичь, только работая в команде. Соответственно, очень важны эффективные коммуникационные навыки, особенно когда реализуются междисциплинарные научные исследования — в этом случае умение работать в команде, делиться идеями и принимать конструктивную критику — ключевые факторы успеха.
— Как вы находите баланс между научной работой и личной жизнью, особенно в период интенсивных исследований?
В данном случае очень важно правильно расставлять приоритеты и организовывать рабочее время таким образом, чтобы не забывать о домашних обязанностях, а также находить время для отдыха и увлечений. Безусловно, в жизни ученого случаются периоды интенсивных экспериментальных исследований, что требует определенных жертв в плане отдыха и общения с семьей. Тем не менее, правильная расстановка приоритетов помогает поддерживать здоровые отношения в семье, сохраняя при этом продуктивность в научной деятельности.
— Как современная наука использует данные большие объёмы информации и биоинформатику для создания эффективных вакцин?
Уже ни для кого не секрет, что в современных научных проектах для создания эффективных вакцин активно используются большие объемы данных и методы биоинформатики. Это стало особенно заметно в свете недавних эпидемий и пандемий, таких как COVID-19. Процесс создания таких вакцин включает в себя несколько ключевых этапов, на каждом из которых анализ данных и биоинформатические методы играют центральную роль. Так, в первую очередь необходимо собрать и проанализировать огромные массивы данных о геномах соответствующих патогенов, при этом современные технологии секвенирования ДНК и РНК позволяют быстро получать полные геномы вирусов и бактерий. Эти данные помогают ученым идентифицировать ключевые элементы патогенов, участвующие в его репликации или взаимодействии с иммунной системой хозяев, а разные биоинформатические подходы позволяют проводить сравнительный анализ геномов различных штаммов, что не только позволяет отслеживать мутации и оценивать возможные варианты вирусов, но и помогает разработчикам вакцин находить особо консервативные участки, которые могут выступать антигенами для создания вакцин широкого спектра действия.
Также для создания эффективных вакцин требуются знания о том, как иммунная система реагирует на инфекции. В этой связи также биоинформатические методы помогают моделировать иммунные ответы, предсказывая, какие антигены (вирусные белки) способны вызывать наиболее мощный иммунный ответ. На это указывают алгоритмы машинного обучения, которые анализируют существующие данные о взаимодействии антигенов и антител, предоставляя потенциальные цели для разработки вакцин.
Далее, когда идентифицированы потенциальные антигены-мишени для разработки вакцины, проводятся рутинные лабораторные манипуляции, пока еще не требующие обработки больших массивов данных, но уже на этапе доклинической и клинической оценки вакцинных кандидатов снова требуются биоинформатических инструментов для обработки и анализа результатов вакцинации в плане изучения взаимосвязи между введением вакцины и развитием поствакцинальных реакций, а также для углубленного изучения формирования всех звеньев адаптивного иммунного ответа.
— Как вы справляетесь с профессиональными вызовами и стрессом, связанным с высокой конкуренцией в научной сфере?
Действительно, в настоящее время практически каждый ученый испытывает определенный уровень стресса из-за высокой конкуренции в научной сфере, в первую очередь это касается написания грантовых заявок, где зачастую поддерживают не более 10% поданных заявок. Тут только один способ решения проблемы — не сдаваться ни при каких обстоятельствах и продолжать участвовать в конкурсах, принимая во внимание все высказанные экспертами замечания, постепенно доводя свою заявку до совершенства. Также немаловажным является поиск партнеров из других организаций с предложениями о проведении совместных научных исследований, при этом четко осознавая свои возможности, чтобы не блуждать бесцельно в большом количестве проектов и идей. Соответственно, справляться с профессиональными вызовами и стрессом, особенно в высококонкурентной научной среде, можно, устанавливая четкие цели и приоритеты, сосредотачиваясь на наиболее актуальных задачах — все это снизит чувство перегруженности и позволит лучше управлять своим временем.
— Какие советы вы бы дали молодым ученым, которые только начинают свою карьеру в научной среде?
В первую очередь, хорошо выполняйте свою работу — если взялись за что-то, доведите до конца. И при этом не отчаивайтесь при возможных неудачах, ведь зачастую процесс поиска причины того, что что-то не сработало, и приводит к более глубокому пониманию всего процесса в целом.
Также очень важно беречь свою научную репутацию, перепроверять свои результаты, не пытаться бездумно «подгонять» результаты экспериментов под определенную концепцию. Ведь вся цель научных исследований — это поиск истины, а не простое подтверждение или опровержение гипотез.
Никогда не упускайте возможностей — если есть даже небольшая вероятность получить поддержку вашего проекта, включиться в новую программу, обязательно надо пытаться и не опускать руки при первых же неудачах.
Болейте за свое дело — всегда будьте в курсе, над чем сейчас работают в мире, отслеживайте новые тренды в вашей дисциплине, не бойтесь начинать что-то совершенно новое!