Биологи определили полные геномные последовательности изолятов этого вируса из деревьев инжира сорта Belle dure. Полученные геномы сильно отличались от геномов гавайских изолятов и при филогенетическом анализе образовывали отдельную группу. Результаты работы внесли важный вклад в изучение географического распространения и генетического разнообразия вирусов инжира.
Инжир (фиговое дерево) – одна из самых древних продовольственных культур, распространенная в тропических и субтропических зонах. Серьезным заболеванием инжира является мозаичная болезнь, которая проявляется в виде пятнистости и деформации листьев, нарушения их окраски, раннего опадания плодов. Считается, что болезнь имеет вирусную этиологию. По данным ученых, фиговое дерево может быть заражено 15 вирусами, и этот список постоянно пополняется. Так, в 2021 году на Гавайях у деревьев с симптомами мозаичной болезни был обнаружен новый умбра-подобный вирус. В результате совместного заражения разными вирусами могут меняться внешние проявления заболевания.
Коллектив российских ученых, состоящий из сотрудников кафедры вирусологии биологического факультета МГУ, в течение нескольких лет изучает вирусы в насаждениях фиговых деревьев в Никитском ботаническом саду в Ялте. В Саду содержится обширная коллекция фиговых деревьев, у трети из которых наблюдаются симптомы мозаичной болезни.
Ученые изучили зараженность коллекции умбра-подобным вирусом инжира с помощью ОТ-ПЦР (полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией). Вирус был диагностирован в пяти деревьях инжира сорта Belle dure, завезенных из Франции. В других сортах и видах инжира он не был обнаружен. С помощью высокопроизводительного секвенирования были определены полные последовательности генома вирусных изолятов.
Биологи сравнили их с известными последовательностями других умбра- и умбра-подобных вирусов. Оказалось, что геномы российских изолятов довольно сильно, примерно на 20%, отличаются от гавайских и при филогенетическом анализе образуют отдельную группу. Очевидно, крымские и гавайские изоляты имеют общего предка и представляют собой дивергентные формы одного и того же вируса.
«Дерево инжира сорта Belle dure, завезенное в Крым из Франции, уже, видимо, было заражено умбра-подобным вирусом. Это может означать, что вирус распространен не только в Крыму и на Гавайях, но и в других регионах возделывания этой культуры, и указывает на необходимость проверки интродуцируемых растений на вирусы», – пояснил Сергей Чирков, один из авторов статьи, ведущий научный сотрудник кафедры вирусологии биологического факультета МГУ.
Исследование опубликовано в журнале Plants.
